شخصیت اصلی این بازی "مارکوس هالووی" ( Marcus Holloway ) نام دارد؛ یک هکر که قربانی الگوریتم سیستم عامل ctOS 2. 0 است. او به جرمی متهم شده که هرگز مرتکب آن نشده است. شهر "سان فرنسیسکو" ( San Fransisco ) آخرین شهری است که به تکنولوژی ctOS 2. 0 مجهز شده و مارکوس قصد دارد آن را برای همیشه نابود ( آفلاین ) کند. در عنوان Watch Dogs 2 بازیکنان در پیشروی مراحل حق انتخاب دارند؛ انجام ماموریت ها به صورت مخفیانه و